Rayon Al-Kindi berdiri pada 2014 sebagai bagian dari perkembangan kaderisasi PMII Surabaya Selatan di lingkungan fakultas-fakultas baru UIN Sunan Ampel Surabaya. Saat ini, Al-Kindi menjadi wadah kaderisasi mahasiswa di Kampus 2 UINSA, meliputi Fakultas Sains dan Teknologi (Saintek), Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik (FISIP), serta fakultas lainnya di lingkungan Kampus 2.

Rayon Al-Farabi berdiri pada 2014 sebagai bagian dari perkembangan struktur kaderisasi Komisariat Al-Fatih. Rayon ini menjadi wadah kaderisasi mahasiswa Fakultas Syariah dan Fakultas Ekonomi dan Bisnis (FEBI) dalam memperluas basis kader PMII Surabaya Selatan.

Rayon Ushuluddin merupakan wadah kaderisasi PMII Surabaya Selatan bagi mahasiswa Fakultas Ushuluddin UIN Sunan Ampel Surabaya. Rayon Ushuluddin diresmikan pada 17 Mei 2025, sebagai bagian dari penguatan struktur kaderisasi PMII Surabaya Selatan di lingkungan Fakultas Ushuluddin.

Rayon Dakwah merupakan wadah kaderisasi PMII Surabaya Selatan bagi mahasiswa Fakultas Dakwah dan Komunikasi UIN Sunan Ampel Surabaya. Rayon Dakwah diresmikan pada 12 Oktober 2024, yang menjadi salah satu tonggak penting dalam penguatan struktur dan regenerasi kader PMII Surabaya Selatan.